主人公『近衛刀太』目線でUQ HOLDER！の物語を進めていくストーリーモード賞金首やパワフルハンドの刺客達を撃破し、フェイト・アーウェルンクスやネギ＝ヨルダの元へたどり着け！
麻帆良学園3-A生徒達とのオリジナルストーリーを実装したストーリーモード。ネギ・スプリングフィールド目線で生徒達と戯れよう！
鍛えた仲間を連れて行き、塔の頂点を目指す20連戦のタワーバトルスコアを競う全国ランキングで上位入賞者になり特別な報酬を入手しよう！
期間限定の強敵を倒すレイドバトル。最初の強敵は『超鈴音』火星からの来襲だ！
曜日別育成ダンジョン。手に入れた仲間と毎日修行を重ね、最強を目指そう！